Nu Quantum Break op de markt is voor de Xbox One en pc, hebben sommige mensen zich afgevraagd over het verhaal en het einde van de game, op zoek naar wat uitleg over wat er echt is gebeurd. Nou, het is een beetje verwarrend, maar het einde is logisch in de context van de gamewereld en het verhaal zelf is een stuk kleiner dan het lijkt tijdens het spelen.

Het begint met Monarch die een universiteitscampus overvallen waar broers Will en Jack Joyce samen zijn met Jack's vriend Paul Serene. Het trio checkt in 2016 de tijdmachine van Will. Tijdens de overval raakt Paul in de val en gaat door de tijdmachine om zichzelf te redden. Paul en Jack waren jeugdvrienden, dus wanneer Paul in de tijdmachine stapt om niet gedood te worden, probeert Jack hem te redden. Beiden worden blootgesteld aan ruwe doses Chronon, waardoor ze de tijd kunnen manipuleren. Paul krijgt er een grotere blootstelling aan en ontwikkelt een ziekte die zijn aanwezigheid in de tijd zelf doet vervallen en de continuïteit van zijn aanwezigheid in de tijd verstoort.

Toen Paulus reist door de tijdmachine eindigt hij op naar het "einde der tijden" in de verre toekomst, niet in tegenstelling tot het 'einde der tijden' in Chrono Trigger. Er wordt gezegd dat het een gevaarlijke en vijandige plek is waar Paul en anderen moeten vechten om te overleven. Paul raakt uiteindelijk gewond door Beth Wilder in het einde der tijden, maar slaagt erin te ontsnappen en terug te keren naar 1999, samen met Beth. Paul verbleef een aantal jaren aan het einde der tijden, in een poging te overleven en een manier te vinden om de ramp te voorkomen, maar dat lukte niet.

Eenmaal teruggekomen in 1999, probeert Paul Serene Will te vermoorden, maar dat mislukt. Paul maakt het zijn enige missie om zich voor te bereiden op het einde der tijden door een reeks voorzorgsmaatregelen te nemen. Hij opent het Monarch-bedrijf voor dit exacte doel, en in de loop van de jaren gebruikt hij het om middelen op te bouwen en een zogenaamde reddingsboot om geselecteerde mensen te beschermen tegen het einde der tijden. De reddingsboot wordt aangedreven door een tegenmaatregel gemaakt door Will Joyce, de Chronon Field Regulator.

Tijdens de overval op de bibliotheek in de huidige tijd met Will en Jack, leidt een oudere en vermoeide Paul Serene de aanval om de tijdkern te nemen voor Monarchs eigen tijdmachine. Ze hebben de kern en het CFR nodig voor het Lifeboat-initiatief. Paul doodt schijnbaar Will tijdens de inval en vangt Jack.

Jack heeft echter een deel van de tijdkrachten ontwikkeld die Paul heeft, en hij kan ontsnappen uit de klauwen van Monarch. Jack krijgt wat hulp van Nick of Amy die in de bibliotheek waren op de avond dat Monarch de campus binnenviel en de tijdkern stal. Afhankelijk van de keuzes die de speler maakt, zal Nick of Amy Jack vergezellen tijdens een aantal van zijn reizen.

Jack komt te weten over Wills tijdmachine in een verlaten zwemgelegenheid nadat hij een sleutel heeft gevonden voor de faciliteit in Will's geval. Beth is een mol in Monarch die Jack helpt en vergezelt naar het zwembad om de tijdmachine te gebruiken om terug te gaan en de breuk te repareren om te voorkomen dat het einde der tijden plaatsvindt, maar ze kunnen de tijdmachine niet aan het werk krijgen. Om de machine te repareren hebben ze hulp nodig van Monarch's Sofia Amaral, die toevallig de liefdesbelang van Paul Serene is en degene die hem de behandeling geeft om zijn tijdziekte op te lossen.

Om Sofia te pakken te krijgen, ontvoeren ze haar van een feest op een Monarch-eiland; Om bij het eiland te komen, laat Jack zich vangen. Afhankelijk van de keuzes die spelers maken, wordt onthuld dat Paul's rechterhand, Martin Hatch, de hele tijd tegen hem aan het beramen is en Jack bevrijdt zodat Jack Paul kan stoppen.

Na het ophalen van gratis, Jack en Beth beheren om Sofia te vangen en breng haar naar het zwembad om de tijdmachine te repareren - Jack en Beth plan terug in de tijd te gaan naar de tegenmaatregel om de breuk vast te stellen en te stoppen Paul Serene krijgen. Echter, Sofia maakt een aantal wijzigingen in de tijdmachine berekeningen en stuurt Beth aan het Einde der Tijden. Terwijl worstelen om te overleven in het Einde der Tijden, Beth ontmoet een jonge Paul Serene en slaagt erin om hem te verwonden; zowel Paul en Beth reis terug naar 1999 waar Beth geeft haar jongere zelf een notebook van alles om te komen en voor te bereiden.

Tijdens haar strijd om te overleven in het Einde der Tijden, verliest Beth de wil om te vechten na het maken van het aan 1999. Jack hoofden terug naar 2010 de tegenmaatregel krijgen, maar niet in slaagt om dit te doen. Paul Serene, na te hebben vastgesteld Monarch, krijgt in een gevecht met Jack en Beth. Beth wordt neergeschoten en Jack krijgt terug naar 2016 geteleporteerd na de CFR gaat uit en creëert de oorspronkelijke breuk in de tijd in 1999. Paul doodt Beth en neemt de tegenmaatregel, met behulp van het voor de Reddingsboot protocol.

Nadat hij terug naar 2016 gekatapulteerd, Jack beslist om de CFR tegenmaatregel apparaat te nemen van Monarch eens en voor altijd op tijd op te lossen. Hij aan het hoofd van hun hoofdgebouw waar Monarch de Lifeboat protocol is geïnitieerd omdat Paulus en Sofia zijn van mening dat het Einde der Tijden is nabij. Jack krijgt een beetje hulp van een security engineer genaamd Charlie, maar Charlie sterft door zich neergeschoten door Martin Hatch terwijl het proberen om Jack te helpen.

In een van de keuzes, nadat Martin Hatch Charlie heeft vermoord, krijgt een van Monarchs elitesoldaten die beschuldigd werd van verraad aan het bedrijf, Liam Burke, ruzie met Hatch en slaagt erin hem schijnbaar te doden. Hatch sterft echter niet.

Binnen deze keuze is Burke ervan overtuigd door Paul Serene om Jack te bevechten en Paul en de rest van Monarch tijd te kopen om het Lifeboat-protocol volledig operationeel te krijgen. Paul belooft Liam's zwangere vrouw Emily te beschermen en brengt haar naar de reddingsboot.

Tegen de tijd dat Jack krijgt om de CFR op de top van het gebouw, Liam is bijna dood na een schotwond te hebben last van eerder. Toch Liam vecht op om Jack te houden van het krijgen van zijn handen op de CFR. Liam is gemakkelijk verslagen en Jack neemt de CFR en reist door de tijdmachine terug naar de bibliotheek waar Monarch eerst de universiteit om de tijd kern stelen aangevallen.

Jack slaagt erin om Will te redden van wordt verpletterd door de vallend puin en de twee reizen naar de geheime zwembad faciliteit om een ​​paar dagen te reizen naar de toekomst waar Jack oorspronkelijk vandaan kwamen. Paul Serene heeft mannen te wachten voor de twee broers, en wanneer ze aankomen een vuurgevecht volgt. Paul en zijn mannen worden verslagen en Will en Jack slagen om schijnbaar bevestig de tijd breuk met behulp van de CFR tegenmaatregel.

Tijdens dit proces lijkt Jack echter op dezelfde manier geïnfecteerd te raken als Paul dat oorspronkelijk deed. Jack gaat uiteindelijk naar Monarch om te praten over hulp bij zijn probleem. Het blijkt dat Martin Hatch niet stierf en bereid is om met Jack samen te werken om zowel het imago van Monarch te helpen herstellen als Jack mogelijk te genezen van zijn tijdziekte. Het spel eindigt met Jack die de twee voorgeschoteld krijgt, die de morele keuzes bepalen die Paul Serene gewoonlijk tijdens het verhaal van het spel kreeg.